目的:了解南京高校大学生亚健康状况，为健康干预提供依据。方法:抽取江苏省南京市两所大学在校1~4年级全日制学生，发放问卷1387份，由副主任医师指导调查对象填写问卷，现场询问病史和中医四诊、作出证候诊断。共计回收有效问卷1227份，采用SPSS for Windows 8.0/Excel 2007进行统计、独立组平均数差异检验和双变量相关显著性检验。结果:大学在校生亚健康总体发生率84.43%。从低年级到高年级躯体亚健康症状呈上升趋势，但学生组间平均差异不显著（P>0.05）；大学四年级学生的躯体方面症状最为明显，与其它三组的组间平均数、差异均达到显著水平(P<0.01)。女同学症状均较男同学更为明显，并且差异随年级增高不断加大。中医证候在亚健康大学生中的发生率68.05%，其中，肝郁脾虚证、脾虚湿阻证、肝气郁结证占前三位。生活方式存在问题女生多于男生，但对健康干预的认知度高于男生。结论:大学在校生广泛存在亚健康状况，需要学校加强关注，积极预防亚健康发生。